MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii ACICU plasmid pACICU1

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010605	T	8	8	21	28	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010605	A	6	6	50	55	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010605	AGCGAA	2	12	72	83	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010605	AGCGA	2	10	99	108	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_010605	ATT	2	6	144	149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010605	ATA	2	6	333	338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010605	A	6	6	361	366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010605	ATT	2	6	1943	1948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010605	GCT	2	6	1957	1962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010605	GAA	2	6	2008	2013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010605	AAAAAG	2	12	2031	2042	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010605	ATT	2	6	2056	2061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010605	TGA	2	6	2091	2096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010605	AAT	2	6	2097	2102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010605	A	7	7	2125	2131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010605	TAT	2	6	2216	2221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010605	AAATA	2	10	2277	2286	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010605	ATAA	2	8	2297	2304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010605	A	7	7	2310	2316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010605	ATAA	2	8	2350	2357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010605	ATACTT	2	12	2365	2376	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_010605	AT	3	6	2477	2482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010605	T	7	7	2482	2488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010605	AAT	2	6	2514	2519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010605	ATA	2	6	2537	2542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010605	T	6	6	2543	2548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010605	ATTA	2	8	2572	2579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010605	GGT	2	6	2626	2631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010605	ATC	2	6	2641	2646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010605	T	7	7	3446	3452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010605	CTT	2	6	3488	3493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010605	GCT	2	6	3494	3499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010605	ATT	2	6	3521	3526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010605	CTTAA	2	10	3658	3667	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_010605	AAAAC	2	10	3677	3686	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_010605	AAC	2	6	3714	3719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010605	T	6	6	3816	3821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010605	AGCT	2	8	3880	3887	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010605	A	6	6	3895	3900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010605	AAC	2	6	4323	4328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010605	CAT	2	6	4348	4353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010605	ATT	2	6	4359	4364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010605	ACCT	2	8	4371	4378	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010605	AAC	2	6	4425	4430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010605	TA	3	6	5448	5453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010605	CAA	2	6	5472	5477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010605	TAAA	2	8	5491	5498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010605	GAATG	2	10	5513	5522	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010605	GAATG	2	10	5535	5544	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010605	GAATG	2	10	5557	5566	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010605	CAGC	2	8	5614	5621	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010605	TAA	2	6	5648	5653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010605	T	6	6	5659	5664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010605	TCAT	2	8	5768	5775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010605	AT	3	6	5785	5790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010605	T	6	6	6785	6790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010605	GTTG	2	8	6848	6855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010605	T	7	7	6901	6907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010605	ATTG	2	8	7926	7933	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010605	AT	3	6	7986	7991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010605	T	8	8	8009	8016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010605	ATC	2	6	8078	8083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010605	AGT	2	6	8117	8122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010605	GA	3	6	8180	8185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010605	ATT	2	6	8241	8246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010605	TAC	2	6	8330	8335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010605	CAG	2	6	8394	8399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010605	AAC	2	6	8422	8427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010605	AGC	2	6	8477	8482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010605	T	6	6	8486	8491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010605	CA	3	6	8515	8520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010605	TAAA	2	8	9445	9452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010605	A	6	6	9450	9455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010605	TAATT	2	10	9608	9617	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010605	GAA	2	6	9633	9638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010605	ATT	2	6	9726	9731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010605	A	7	7	9736	9742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010605	TAA	2	6	9784	9789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010605	T	6	6	9877	9882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010605	TCT	2	6	9908	9913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010605	TTA	2	6	10647	10652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010605	AAT	2	6	10725	10730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010605	GCTT	2	8	10769	10776	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_010605	TAT	2	6	10825	10830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010605	TAAAC	2	10	11432	11441	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_010605	A	6	6	11623	11628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010605	CAA	2	6	11656	11661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010605	GA	3	6	11684	11689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010605	GA	3	6	11962	11967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010605	TAAA	2	8	13197	13204	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010605	TTC	2	6	13334	13339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010605	GAA	2	6	14279	14284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010605	TCA	2	6	14824	14829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010605	T	6	6	14865	14870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010605	AAT	2	6	14889	14894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010605	AGA	2	6	14928	14933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010605	A	6	6	14948	14953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010605	CTT	2	6	14987	14992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010605	AAT	2	6	15005	15010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010605	GCA	2	6	15025	15030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010605	CAC	2	6	15043	15048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_010605	TAT	2	6	15121	15126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010605	TTC	2	6	15141	15146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010605	GAT	2	6	16262	16267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010605	CAC	2	6	16276	16281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_010605	TAAA	2	8	17211	17218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010605	TTC	2	6	17348	17353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010605	GAA	2	6	18293	18298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010605	TCA	2	6	18838	18843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010605	T	6	6	18879	18884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010605	AAT	2	6	18903	18908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010605	AGA	2	6	18942	18947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010605	A	6	6	18962	18967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010605	CTT	2	6	19001	19006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010605	AAT	2	6	19019	19024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010605	GCA	2	6	19039	19044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010605	CAC	2	6	19057	19062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_010605	TAT	2	6	19135	19140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010605	TTC	2	6	19155	19160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010605	GAT	2	6	20276	20281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010605	CAC	2	6	20290	20295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_010605	T	8	8	20336	20343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010605	T	8	8	20369	20376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010605	AGTG	2	8	20437	20444	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010605	ATAA	2	8	20496	20503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010605	A	6	6	20502	20507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010605	ATT	2	6	24175	24180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010605	ATA	2	6	24184	24189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010605	TTG	2	6	24245	24250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010605	AGC	2	6	24292	24297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010605	TAA	2	6	24312	24317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010605	CAA	2	6	24328	24333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010605	AATT	2	8	24338	24345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010605	TTA	2	6	24376	24381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010605	T	7	7	24445	24451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010605	A	6	6	24477	24482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010605	ATA	3	9	24492	24500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010605	CTT	2	6	24578	24583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010605	TCT	2	6	24601	24606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010605	TCT	2	6	24631	24636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010605	T	6	6	24646	24651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010605	ATCT	2	8	24665	24672	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_010605	TCTT	2	8	24702	24709	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010605	GCTT	2	8	24751	24758	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_010605	TA	3	6	24760	24765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010605	CAT	2	6	24818	24823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_010605	TTC	2	6	24831	24836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_010605	TAA	2	6	24887	24892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010605	TACC	2	8	24919	24926	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_010605	GCTT	2	8	24942	24949	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_010605	CAA	2	6	24970	24975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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186	NC_010605	A	6	6	27701	27706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_010605	A	6	6	27739	27744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.